В мире три разных штамма вируса. США заражены оригинальным

сегодня ИноСми со ссылкой  на Daily Mail опубликовало статью по исследованиям, призванным отследить распространение различных мутаций в мире.

итак, выдержки

"Анализ штаммов показал, что тип А - исходный вирус, который передался людям от летучих мышей через ящериц - не был самым распространенным в Китае. Эпицентр пандемии в Китае был в основном поражен типом В, который распространялся еще в канун Рождества"

"Результаты показали, что тип A наиболее распространен в Австралии и США, где было зарегистрировано более 400 тыс. случаев COVID-19. Две трети американских образцов принадлежали к типу А, но инфицированные пациенты были, в основном, выходцами с Западного побережья, а не из Нью-Йорка"

"Кембриджские ученые обнаружили, что две трети из 310 образцов вирусов, секвенированных в США, принадлежат к типу А. И все американские случаи, связанные с круизными судами, имели штаммы типа В. Непонятно, на каких кораблях они заразились вирусом, но на корабле Diamond Princess, который в течение нескольких недель находился на карантине у берегов Японии, было зафиксировано более 700 случаев инфицирования. Данные показали, что первые два случая - как предполагается, ими были студент университета Йорка и его мать в конце января, имели тип A, что заставляет предположить, что они заразились им в Китае. Больше ни одного образца из Англии, Шотландии или Уэльса не принадлежало к типу A, в то время как 30 из 40 вирусов были отнесены к типу B".

"Большинство случаев в Ухане относится к типу B, в то время как производный тип C возник позднее и первоначально распространялся через Сингапур", - сказал доктор Фостер. Он предположил, что тип С не мутирует, однако призвал относиться к его открытию с осторожностью, указывая на то, что выборка была очень маленькой",

много букв по ссылке https://yandex.ru/turbo?text=https%3A%2F%2Fwww.inopressa.ru%2Farticle%2F...

Первоисточником публикации по видимому служит научная статья в журнале научных трудов Национальной академии наук (PNAS) https://www.pnas.org/content/early/2020/04/07/2004999117

"Филогенетический анализ сети геномов SARS-CoV-2". 

Текс самой статьи не столь категоричен, как стиль Daily Mail

"Аннотация

В анализе филогенетической сети 160 полных геномов коронавируса 2 (SARS-Cov-2) человека с тяжелым острым респираторным синдромом мы обнаруживаем три центральных варианта, отличающихся аминокислотными изменениями, которые мы назвали A, B и C, причем A является по наследственному типу по данным летучей мыши внегрупповой коронавирус. Типы A и C встречаются в значительной степени за пределами Восточной Азии, то есть у европейцев и американцев. Напротив, тип B является наиболее распространенным типом в Восточной Азии, и его наследственный геном, по-видимому, не распространился за пределы Восточной Азии без предварительного мутации в производные типы B, что указывает на эффекты основателя или иммунологическую или экологическую устойчивость против этого типа за пределами Азии. Сеть достоверно отслеживает пути заражения для зарегистрированных случаев коронавирусной болезни 2019 (COVID-19).

...

Есть два подкласса А, которые отличаются синонимом мутации T29095C. В подкластере T-аллеля четыре китайских человека (из южной прибрежной китайской провинции Гуандун) несут наследственный геном, в то время как три японских и два американских пациента отличаются от него рядом мутаций. Эти американские пациенты, как сообщается, имели историю проживания в предполагаемом источнике вспышки в Ухане. Подкластер C-аллеля имеет относительно длинные мутационные ветви и включает пять особей из Ухани, два из которых представлены в предковом узле, и восемь других восточноазиатских из Китая и соседних стран. Следует отметить, что почти половина (15/33) типов в этом подкластере, однако, обнаружены за пределами Восточной Азии, главным образом в Соединенных Штатах и ​​Австралии.

Два производных сетевых узла поражают с точки зрения количества особей, включенных в узловой тип и в мутационные ветви, исходящие от этих узлов. Мы пометили эти филогенетические кластеры B и C.

Для типа B все, кроме 19, из 93 геномов типа B были отобраны в Ухане ( n = 22), в других частях восточного Китая ( n = 31) и, время от времени, в соседних азиатских странах ( n= 21) За пределами Восточной Азии 10 В-типов были обнаружены в вирусных геномах из США и Канады, один в Мексике, четыре во Франции, два в Германии и по одному в Италии и Австралии. Узел B образован из A двумя мутациями: синонимическая мутация T8782C и несинонимичная мутация C28144T, изменяющая лейцин на серин. Кластер B поразителен с точки зрения длины мутационных ветвей: в то время как наследственный тип B монополизирован (26/26 геномов) восточноазиатцами, каждый геном B-типа (19/19) за пределами Азии развил мутации. Это явление, по-видимому, не связано с длительностью запаздывания в месяц и сопутствующей частотой мутаций, воздействующих на вирусный геном до его распространения за пределами Китая ( набор данных S1, дополнительная таблица 2).). Сложный сценарий основателя является одной из возможностей, и стоит рассмотреть другое объяснение, заключающееся в том, что наследственный вирус Уханьского типа В иммунологически или экологически адаптирован для большой части населения Восточной Азии и может нуждаться в мутировании, чтобы преодолеть сопротивление за пределами Восточной Азии.

Тип C отличается от своего родительского типа B несинонимичной мутацией G26144T, которая превращает глицин в валин. В наборе данных это основной европейский тип ( n = 11), с представителями во Франции, Италии, Швеции и Англии, а также в Калифорнии и Бразилии. Он отсутствует в выборке из материкового Китая, но очевиден в Сингапуре ( n = 5), а также обнаружен в Гонконге, Тайване и Южной Корее...."